Project Details


Name Ecologia Molecular e Taxonomia Polifásica de Bactérias de importância ambiental e agroindustrial   FAPESP Project
Website _
Validity Date 01/10/1999 - 30/09/2004
Team
  • Dr. Gilson Paulo Manfio - Coordenador - CPQBA/UNICAMP
  • Dr. Carlos A. Moreira Filho - ICB/USP
  • Dr. Crodowaldo Pavan - ICB/USP
  • Dra. Heloiza Barbosa - ICB/USP
  • Dr. Júlio Rodrigues Neto - Instituto Biológico de Campinas
  • Dra. Laura M. M. Ottoboni - CBMEG/UNICAMP
  • Dra. Maria Inêz Sato - CETESB
  • Dra. Rosana F. Vazoller - ICB/USP
  • Dra. Suzete Lanza Destefano - Instituto Biológico de Campinas
  • Dra. Valéria Maia de Oliveira 0- CPQBA/UNICAMP)
  • Dr. Vanderlei P. Canhos - CRIA
  • Dra. Vivian H. Pelizari - ICB/USP
Participating Institutions
  • CBMEG - UNICAMP, Campinas
  • CETESB, São Paulo
  • CNPMA - EMBRAPA, Jaguariúna
  • CPQBA/UNICAMP, Campinas
  • ICB/USP, São Paulo
  • Instituto Biológico, Campinas
  • USP/São Carlos
Biome
  • Cerrado paulista - áreas diversas
  • Estuário de Santos-São Vicente (ambiente aquático e sedimentos estuarinos)
Abstract A presente proposta dentro do escopo do Programa BiotaSP visa a estruturação de uma rede temática voltadapara o desenvolvimento de metodologias rápidas de caracterizaçãoe de sistemática molecular microbiana. Entre as metodologiasa serem empregadas nos estudos propostos destacam-se:
  • sequenciamento de rDNA 16S: empregada na análise filogenéticadas relações evolutivas entre organismos, enquadramento taxonômico de organismos desconhecidos em gêneros e espécies, identificação rápida de organismos de difícil caracterização ou cultivo;
  • homologia DNA-DNA: verificação da identidade entre organismos em nível de espécie, avaliaçãode grupos taxonômicos heterogêneos de organismos e definição de novas espécies;
  • quimiotaxonomia: análise de componentes celulares diversos visando o enquadramento de organismos em nível de gêneroe espécie, descrição taxonômica de novos gêneros e espécies;
  • metodologias de tipagem molecular diversas, incluindo RAPD,RFLP de rDNA16S e regiões espaçadoras, REP-, ERIC-e BOX-PCR, DGGE, PAGE, etc.: metodologias para avaliação da diversidade de organismos em nível de gênero,espécie e infra-específico;
  • metodologias de detecção rápida e análisefuncional de microrganismos: sondas moleculares grupo-específicas(incluindo sondas para análise de diversidade in situ)e sondas para genes funcionais (e.g., genes de fixação de nitrogênio, vias de biodegradação, genes de patogenicidade).
Expected Products Estruturação de uma rede cooperativa de laboratórios e especialistas em microbiologia sistemática e taxonomia polifásica de bactérias, voltada principalmente à caracterização e identificação de microrganismos de importância ambiental, agrícola e industrial.

Estruturação de acervos de microrganismos representativos da diversidade microbiana associada aos diversos temas de pesquisa em coleções de culturas existentes no estado de São Paulo com bases de dados associadas disponibilizando via Internet as informações de cunho científico-tecnológico à comunidade.

Estruturação de cursos de treinamento de curta e média duração, incluindo cursos de pós-graduação, destinados à formação de pessoal em nível técnico e/ou universitário nos aspectos de aplicação de metodologias avançadas para caracterização e identificação de microrganismos, sistemática microbiana, ecologia de microrganismos e exploração tecnológica da diversidade microbiana.

Publicação e disponibilização on-line (através da Internet) de protocolos de aplicação de métodos taxonômicos na caracterização e identificação de bactérias e outros microrganismos voltados à aplicação em diversas áreas de microbiologia, incluindo microbiologia ambiental, microrganismos de importância agrícola e industrial, e potencialmente a aplicações futuras em epidemiologia e microbiologia clínica,

Realização e publicação de resultados de trabalhos científicos nas áreas específicas de atuação dos participantes do projeto, enfocando o aspecto de aplicação prática dos conhecimentos gerados na exploração tecnológica da diversidade microbiana brasileira.

Keywords Archaea, Bacteria, Ecologia molecular, taxonomia polifásica
Occurrences 42
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